Продюсер игры Tim Bennison раскрыл в своём интервью с TeamXbox.com, что многопользовательский режим был вырезан из игры Prototype для Xbox 360, Playstation 3 и PC. «Мы решили убрать мультиплеер из игры, потому что поняли, что не сможем довести его до уровня и отточенности одиночной игры.» Так что кооперативного прохождения от Prototype нам теперь ждать не придётся.